Wagner lief im März 1996 in Sun Valley ihr erstes Rennen im Continental-Cup, das sie auf dem sechsten Platz über 5 km klassisch beendete. Ihre ersten von insgesamt 39 Weltcupeinzelrennen absolvierte sie bei den Nordischen Skiweltmeisterschaften 1999 in Ramsau am Dachstein. Dort belegte sie den 69. Platz über 5 km klassisch, den 56. Rang in der Verfolgung und den 46. Platz über 30 km klassisch. Mit der Staffel errang sie dort den 14. Platz. Im Dezember 1999 in Canmore und im Februar 2001 in Marquette holte sie je über 5 km klassisch ihre ersten Siege im Continental-Cup. Ihre besten Platzierungen bei den Nordischen Skiweltmeisterschaften 2001 in Lahti waren der 26. Platz über 10 km klassisch und der 12. Rang mit der Staffel. Im März 2001 holte sie in Oslo mit dem 23. Platz über 30 km klassisch ihre ersten Weltcuppunkte. Im folgenden Jahr erreichte sie dort mit dem 17. Platz im Sprint ihre beste Einzelplatzierung im Weltcup und zum Saisonende mit dem 75. Platz im Gesamtweltcup ihr bestes Gesamtergebnis. Ihre besten Resultate bei den Olympischen Winterspielen 2002 in Salt Lake City waren der 23. Platz über 30 km klassisch und der 13. Rang mit der Staffel.
In der Saison 2002/03 siegte Wagner sechsmal im Continental-Cup und errang zudem jeweils einmal den zweiten und dritten Platz. Ihr bestes Ergebnis beim Saisonhöhepunkt, den Nordischen Skiweltmeisterschaften 2003 im Val di Fiemme war der 32. Platz im 15-km-Massenstartrennen. In der folgenden Saison gewann sie im Continental-Cup in West Yellowstone über 10 km klassisch und in Soldier Hollow über 5 km klassisch und errang zudem dreimal den zweiten Platz. Bei den Nordischen Skiweltmeisterschaften 2005 in Oberstdorf lief sie auf den 50. Platz im Skiathlon, auf den 47. Rang im 30-km-Massenstartrennen und auf den 23. Platz im Sprint. Bei den Olympischen Winterspielen 2006 in Turin kam sie auf den 50. Platz über 10 km klassisch, auf den 35. Rang im Sprint, auf den 14. Patz mit der Staffel und auf den zehnten Rang zusammen mit Kikkan Randall im Teamsprint. Ihr letztes internationales Rennen absolvierte sie im März 2006 beim Nor-Am-Cup in Presque Isle. Dabei holte sie im 30-km-Massenstartrennen ihren 13. Sieg im Continental-Cup.