OPN3

OPN3
Ідентифікатори
Символи	OPN3, ECPN, PPP1R116, opsin 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606695 MGI: 1338022 HomoloGene: 40707 GeneCards: OPN3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • photoreceptor activity; • signal transducer activity; • G protein-coupled photoreceptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • photoreceptor outer segment;
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway; • regulation of circadian rhythm; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • відповідь на стимул; • detection of light stimulus; • detection of visible light; • phototransduction; • cellular response to light stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23596
	13603
	н/д
	ENSMUSG00000026525
	Q9H1Y3
	Q9WUK7
	NM_014322; NM_001030011; NM_001030012; NM_001381855; NM_001381856
	NM_010098
	NP_055137; NP_001368784; NP_001368785
	NP_034228
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OPN3 (англ. Opsin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 402 амінокислот, а молекулярна маса — 44 873^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYSGNRSGGH	GYWDGGGAAG	AEGPAPAGTL	SPAPLFSPGT	YERLALLLGS
IGLLGVGNNL	LVLVLYYKFQ	RLRTPTHLLL	VNISLSDLLV	SLFGVTFTFV
SCLRNGWVWD	TVGCVWDGFS	GSLFGIVSIA	TLTVLAYERY	IRVVHARVIN
FSWAWRAITY	IWLYSLAWAG	APLLGWNRYI	LDVHGLGCTV	DWKSKDANDS
SFVLFLFLGC	LVVPLGVIAH	CYGHILYSIR	MLRCVEDLQT	IQVIKILKYE
KKLAKMCFLM	IFTFLVCWMP	YIVICFLVVN	GHGHLVTPTI	SIVSYLFAKS
NTVYNPVIYV	FMIRKFRRSL	LQLLCLRLLR	CQRPAKDLPA	AGSEMQIRPI
VMSQKDGDRP	KKKVTFNSSS	IIFIITSDES	LSVDDSDKTN	GSKVDVIQVR
PL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Blackshaw S., Snyder S.H. (1999). Encephalopsin: a novel mammalian extraretinal opsin discretely localized in the brain. J. Neurosci. 19: 3681—3690. PMID 10234000

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14007 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9H1Y3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14007 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9H1Y3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[3]