Alors qu'une pandémie décime la population mondiale, une virologue embarquée sur un navire de guerre américain tente de mettre au point un vaccin.
Episode 1
41 minL'ennemi de la paixAux Etats-Unis, la situation est stabilisée et la reconstruction du pays commence. Chandler, devenu chef des opérations navales, est envoyé à Hong Kong pour apporter des échantillons de vaccin. Slattery, lui, s'occupe de le livrer en Asie du Sud-Est, mais est kidnappé lors d'une escale au Vietnam...
Episode 2
40 minSignaux de détresseLes hommes du Nathan James enlevés sont emmenés sur un navire. Green et Burk, seuls membres de l'équipage encore libres, découvrent que leur navire a pris le large. Au même moment, à Hong Kong, Chandler, Wolf et Sasha se mettent à la recherche d'un avion afin de pouvoir rejoindre le Vietnam...
Episode 3
40 minLa légende de TakehayaChandler, Wolf, Sasha, Green et Burk ont réussi à rejoindre le Nathan James. Ils découvrent que les hommes d'équipage kidnappés l'ont été par des pirates qui fréquentent la ville chinoise de Shenzen. Chander est bien décidé à retrouver ses hommes et à comprendre ce qui se trame derrière cet enlèvement...
Episode 4
45 minL'ombre chinoiseTakehaya, le chef des pirates, envoie un message au président Michener : il lui laisse 36 heures pour évacuer ses hommes de Chine où il exécutera les marins qu'il tient prisonniers. En écoutant le message, Chandler réalise que les captifs lui transmettent des données permettant de les localiser...
Episode 5
40 minEn terrain minéLe Nathan James met le cap sur un archipel où seraient détenus ses membres d'équipage. En approchant d'une des îles, le navire se retrouve piégé au milieu de mines marines. Pendant ce temps, aux Etats-Unis, le président Michener est sommé de s'expliquer sur la situation préoccupante en Asie...
Episode 6
40 minExtractionLa mission de Chandler est sur le point d'aboutir. Le président Michener, de son côté, médite amèrement sur l'étrange destinée de son mandat...
Episode 7
40 minDans le noirTandis que les hommes du Nathan James affrontent une horrible menace, le président Michener, de son côté, est malmené suite à une terrible révélation.
Episode 8
45 minJeux de pouvoirLes Etats-Unis sont en deuil après le décès du président Michener. Son vice-président, Howard Oliver, a pris la route pour Saint-Louis, dans le but de s'acquitter de ses nouvelles fonctions. L'USS Nathan James est, de son côté, en marche pour Shenzen où un trafiquant est en mesure de parler à la Navy...
Episode 9
40 minEnfer ou Paradis ?Chandler pourrait être sur le point de découvrir un élément capable de résoudre bien des problèmes. Kara, de son côté, parvient à espionner la Maison-Blanche...
Episode 10
40 minLa raison et la forceAprès la perte de deux navires, et d'hommes de la Navy, Chandler doit réussir sa mission en Asie et anéantir le président Peng. A Saint-Louis, le nouveau président démantèle toutes les mesures actées par son prédécesseur, 48 heures après sa prise de fonction. Il émet un mandat d'arrêt à l'encontre de Chandler...
Episode 11
40 minCoup d'étatKara et Jacob Barnes retournent à Saint-Louis pour empêcher le président Oliver de faire son discours. Ils doivent éviter un coup d'Etat d'Allison Shaw. A l'est de la mer de Chine, Chandler tente de capturer le président Peng. Celui-ci est arrivé de Tokyo afin de détruire les archives nationales du Japon...
Episode 12
42 minRésistanceLes Etats-Unis sont désormais sous l'autorité des dirigeants des régions. Kara et Tex, devenus des criminels recherchés, fuient en compagnie du président Oliver. Ils se rendent à San Diego, où ils espèrent être rejoints par Chandler. Le navire y est attendu afin de remettre un prisonnier...
Episode 13
50 minNe te retourne pasAprès avoir repris le contrôle d'une des régions, le président Oliver et le Commandant Chandler décident de reprendre les autres. Ils envoient une équipe dans chacune d'elles afin d'intercepter leur dirigeant un à un. Les deux hommes veulent également arrêter Allison Shaw, à la tête du coup d'Etat...