Narozen v severočeských Teplicích-Šanově. Rodina se po válce vystěhovala do Cvikova (německy Zwickau). První hudební základy mu poskytli rodiče. Roku 1960 zakládá s přáteli trio kytara, basa, akordeon. Ve stejném roce je přijat na konzervatoř Roberta Schumanna, obor hudební pedagogika. Roku 1965 zahájil studia na Vysoké hudební škole Hannse Eislera ve východním Berlíně. Studoval klarinet, saxofon, dirigování, kompozici a aranžmá. Současně hrál v jazzové skupině Klause Lenzeho. Zde hrál i Henning Protzmann, pozdější baskytarista a manažér skupiny KARAT, jako zpěvák působil Manfred Krug, pozdější komisař Stoever v seriálu TATORT. Roku 1967 si založil vlastní skupinu. Za bicími byl Wolfgang Zicke Schneider, kontrabas Hans Schätzke a u piana Reinhard Lakomy, jehož pozdější LP desky s elektronickou muzikou konkurovaly i skupině Puhdys. Roku 1969 přibyl kytarista Fred Baumert a původní Günther - Fischer - Quartett se změnil na quintet. Později přibrali trumpetistu Hanse-Joachima Graswurma. Skupina koncertovala s jazzovou zpěvačkou Uschi Brüningovou, již zmiňovaným Manfredem Krugem, Veronikou Fischerovou či Reginou Dobberschützovou.
První filmovou hudbu složil roku 1971 pro sci-fi EOLOMEA a stal se jedním z nejplodnějších autorů filmové hudby. V roce 2012 napsal hudbu k SUSHI IN SUHL, byl to jeho 92 film. Roku 1989 napsal muzikál JACK THE RIPPER. Hlavní ženskou roli odezpívala Katrin Weberová. Günther Fischer je všestranný hudební skladatel, kterému nedělá problémy soul, folk, jazz, beat, rock, lidové písně. On sám si jednou utahoval z novinářky, že zapomněla na morseovku. Roku 1978 pracoval na západoněmeckém KRÁSNÝ GIGOLO, UBOHÝ GIGOLO. Šlo o poslední film Marlene Dietrichové, která zde hrála baronesu von Semering. Film byl pojmenován podle stejnojmenné písně, kterou zde Marlen zpívá, ale autorem není Günther Fischer. Jedná se o původní šlágr z roku 1929, autorů Juliuse Brammera (text) a Leonella Casucciho (hudba). Brammer byl rakušák (narodil se v Sehradicích u Zlína) a text, líčící pád monarchie napsal roku 1924 v berlínském hotelu Adlon. Roku 1928 k němu Casucci složil tango s 16-taktovým refrénem. 22. srpna 1929 ji nahrál orchestr Dajose Bély pro Odeon a zrodil se hit, který neměl obdoby. Rozšířil se Evropou a práva zakoupila i americký společnost Warner Music Group. V roce 1930 ji nazpíval Louis Armstrong. Rok po něm Bing Crosby a Leo Reisman. Skladba dostala roku 1945 nové aranžmá ve stylu rockového swingu a jako JUST A GIGOLO znovu dobývala žebříčky a hlavně peněženky zákazníků prodejen gramodesek. V roce 1956 byla přezpívána Louisem Prima. Od roku 1978 ji má ve svém repertoáru skupina Village People (ti co jsou odkojeni radiem Luxembourg nezapomenou na jejich hity MACHO MAN, či IN THE NAVY).
Ale zpět ke Güntherovi. Od roku 1997 žije v irském Corku. Je otcem zpěvačky Laury Fischerové, s kterou příležitostně vystupuje. Ve skladatelské filmografii vpravo je chybně uveden jako autor hudby tv seriálu DER STAATSANWALT HAT DAS WORT. Skutečnými autory hudby jsou Karl-Heinz Schröder a Peter Gotthardt.
ČSFD.cz