Am dritten Tag bittet Lumia bzw. Lumius den Hauptcharakter im Zuge der Einleitung der fünften Hauptmission „Yonas Auftrag“ zum Übungsplatz zu kommen. Dort angekommen berichtet sie bzw. er von den Problemen mit dem eigenen Partner-Pokémon Pikachu und bittet um einen Pokémon-Kampf. Nach dem Kampf wird das Pokémon-Team vollständig geheilt. Lumia bzw. Lumius erzählt dem Hauptcharakter anschließend von den Typen-Wechselwirkungen mit entsprechendem Eintrag in der Forschungsfibel. Anschließend kommt Belila, die Kommandantin des Sicherheitstrupps. Sie informiert den Hauptcharakter über die verschiedenen Attacken-Ausführungen Standardausführung, Krafttechnik und Tempotechnik mit entsprechender Freischaltung des Forschungsfibel-Eintrages Tempotechnik und Krafttechnik. Zum Abschluss gibt Belila noch den Hinweis, dass sie als Attacken-Lehrerin fungiert. Nach dem Gespräch bittet Lumia bzw. Lumius den Hauptcharakter zum Fuße des Ambitionshügels zu kommen, damit dieser Yonas Auftrag annehmen kann. Damit beginnt offiziell die fünfte Hauptmission „Yonas Auftrag“.
Sobald der Hauptcharakter mindestens ein 4-Sterne-Mitglied ist und die zehnte Hauptmission „Dünne Luft und steile Pfade“ begonnen hat, erwartet Perla diesen zusammen mit Hin beim Übungsplatz. Der Wächter wird ihn zum Reit-Pokémon Snieboss führen. Nach ein paar weiteren Worten verabschieden sich diese.
Hinweis: Hin kann erneut herausgefordert werden, sobald sein zweites Team besiegt wurde. Bei diesem Kampf tritt er nur mit Elite-Pokémon an und schickt alle drei gleichzeitig in den Kampf.
Im Wettkampfpfad können jeweils drei Charaktere hintereinander zu einem Kampf herausgefordert werden. Der Spieler hat dabei die Möglichkeit, gegen Mitglieder der Galaktik-Expedition, des Diamant-Clans oder des Perl-Clans zu kämpfen. Erstere können nach Nebenmission 102 herausgefordert werden, der Diamant-Clan nach 106 und der Perl-Clan nach Nebenmission 107. Als Belohnung für einen Sieg erhält der Spieler EP-Bonbons und Entwicklungssteine.
Nach dem Abschluss von Nebenmission 102 kann der Spieler den Solokämpferpfad bestreiten. Dabei tritt man mit einem einzigen Pokémon gegen Hin und einen ausgewählten Gegner an. Für jeden ersten Sieg erhält der Spieler drei EP-Bonbon L und einen Stempel im Pokédex für das jeweilige Pokémon. Für einen erneuten Sieg mit demselben Pokémon erhält der Spieler drei Mal Leistungssand.