Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ERF
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| ERF, CRS4, PE-2, PE2, ETS2 repressor factor, CHYTS |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 611888 MGI: 109637 HomoloGene: 68516 GeneCards: ERF
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
isolated scaphocephaly[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0007067 мітоз • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 19: 42.25 – 42.26 Mb
| Хр. 7: 25.24 – 25.25 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
ERF (англ. ETS2 repressor factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 58 703[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKTPADTGFA | | FPDWAYKPES | | SPGSRQIQLW | | HFILELLRKE | | EYQGVIAWQG |
DYGEFVIKDP | | DEVARLWGVR | | KCKPQMNYDK | | LSRALRYYYN | | KRILHKTKGK |
RFTYKFNFNK | | LVLVNYPFID | | VGLAGGAVPQ | | SAPPVPSGGS | | HFRFPPSTPS |
EVLSPTEDPR | | SPPACSSSSS | | SLFSAVVARR | | LGRGSVSDCS | | DGTSELEEPL |
GEDPRARPPG | | PPDLGAFRGP | | PLARLPHDPG | | VFRVYPRPRG | | GPEPLSPFPV |
SPLAGPGSLL | | PPQLSPALPM | | TPTHLAYTPS | | PTLSPMYPSG | | GGGPSGSGGG |
SHFSFSPEDM | | KRYLQAHTQS | | VYNYHLSPRA | | FLHYPGLVVP | | QPQRPDKCPL |
PPMAPETPPV | | PSSASSSSSS | | SSSPFKFKLQ | | PPPLGRRQRA | | AGEKAVAGAD |
KSGGSAGGLA | | EGAGALAPPP | | PPPQIKVEPI | | SEGESEEVEV | | TDISDEDEED |
GEVFKTPRAP | | PAPPKPEPGE | | APGASQCMPL | | KLRFKRRWSE | | DCRLEGGGGP |
AGGFEDEGED | | KKVRGEGPGE | | AGGPLTPRRV | | SSDLQHATAQ | | LSLEHRDS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|