Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PHF3 (англ. PHD finger protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 039 амінокислот, а молекулярна маса — 229 481[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDIVDTFNHL | | IPTEHLDDAL | | FLGSNLENEV | | CEDFSASQNV | | LEDSLKNMLS |
DKDPMLGSAS | | NQFCLPVLDS | | NDPNFQMPCS | | TVVGLDDIMD | | EGVVKESGND |
TIDEEELILP | | NRNLRDKVEE | | NSVRSPRKSP | | RLMAQEQVRS | | LRQSTIAKRS |
NAAPLSNTKK | | ASGKTVSTAK | | AGVKQPERSQ | | VKEEVCMSLK | | PEYHKENRRC |
SRNSGQIEVV | | PEVSVSSSHS | | SVSSCLEMKD | | EDGLDSKHKC | | NNPGEIDVPS |
HELNCSLLSE | | TCVTIGEKKN | | EALMECKAKP | | VGSPLFKFSD | | KEEHEQNDSI |
SGKTGETVVE | | EMIATRKVEQ | | DSKETVKLSH | | EDDHILEDAG | | SSDISSDAAC |
TNPNKTENSL | | VGLPSCVDEV | | TECNLELKDT | | MGIADKTENT | | LERNKIEPLG |
YCEDAESNRQ | | LESTEFNKSN | | LEVVDTSTFG | | PESNILENAI | | CDVPDQNSKQ |
LNAIESTKIE | | SHETANLQDD | | RNSQSSSVSY | | LESKSVKSKH | | TKPVIHSKQN |
MTTDAPKKIV | | AAKYEVIHSK | | TKVNVKSVKR | | NTDVPESQQN | | FHRPVKVRKK |
QIDKEPKIQS | | CNSGVKSVKN | | QAHSVLKKTL | | QDQTLVQIFK | | PLTHSLSDKS |
HAHPGCLKEP | | HHPAQTGHVS | | HSSQKQCHKP | | QQQAPAMKTN | | SHVKEELEHP |
GVEHFKEEDK | | LKLKKPEKNL | | QPRQRRSSKS | | FSLDEPPLFI | | PDNIATIRRE |
GSDHSSSFES | | KYMWTPSKQC | | GFCKKPHGNR | | FMVGCGRCDD | | WFHGDCVGLS |
LSQAQQMGEE | | DKEYVCVKCC | | AEEDKKTEIL | | DPDTLENQAT | | VEFHSGDKTM |
ECEKLGLSKH | | TTNDRTKYID | | DTVKHKVKIL | | KRESGEGRNS | | SDCRDNEIKK |
WQLAPLRKMG | | QPVLPRRSSE | | EKSEKIPKES | | TTVTCTGEKA | | SKPGTHEKQE |
MKKKKVEKGV | | LNVHPAASAS | | KPSADQIRQS | | VRHSLKDILM | | KRLTDSNLKV |
PEEKAAKVAT | | KIEKELFSFF | | RDTDAKYKNK | | YRSLMFNLKD | | PKNNILFKKV |
LKGEVTPDHL | | IRMSPEELAS | | KELAAWRRRE | | NRHTIEMIEK | | EQREVERRPI |
TKITHKGEIE | | IESDAPMKEQ | | EAAMEIQEPA | | ANKSLEKPEG | | SEKQKEEVDS |
MSKDTTSQHR | | QHLFDLNCKI | | CIGRMAPPVD | | DLSPKKVKVV | | VGVARKHSDN |
EAESIADALS | | STSNILASEF | | FEEEKQESPK | | STFSPAPRPE | | MPGTVEVEST |
FLARLNFIWK | | GFINMPSVAK | | FVTKAYPVSG | | SPEYLTEDLP | | DSIQVGGRIS |
PQTVWDYVEK | | IKASGTKEIC | | VVRFTPVTEE | | DQISYTLLFA | | YFSSRKRYGV |
AANNMKQVKD | | MYLIPLGATD | | KIPHPLVPFD | | GPGLELHRPN | | LLLGLIIRQK |
LKRQHSACAS | | TSHIAETPES | | APPIALPPDK | | KSKIEVSTEE | | APEEENDFFN |
SFTTVLHKQR | | NKPQQNLQED | | LPTAVEPLME | | VTKQEPPKPL | | RFLPGVLIGW |
ENQPTTLELA | | NKPLPVDDIL | | QSLLGTTGQV | | YDQAQSVMEQ | | NTVKEIPFLN |
EQTNSKIEKT | | DNVEVTDGEN | | KEIKVKVDNI | | SESTDKSAEI | | ETSVVGSSSI |
SAGSLTSLSL | | RGKPPDVSTE | | AFLTNLSIQS | | KQEETVESKE | | KTLKRQLQED |
QENNLQDNQT | | SNSSPCRSNV | | GKGNIDGNVS | | CSENLVANTA | | RSPQFINLKR |
DPRQAAGRSQ | | PVTTSESKDG | | DSCRNGEKHM | | LPGLSHNKEH | | LTEQINVEEK |
LCSAEKNSCV | | QQSDNLKVAQ | | NSPSVENIQT | | SQAEQAKPLQ | | EDILMQNIET |
VHPFRRGSAV | | ATSHFEVGNT | | CPSEFPSKSI | | TFTSRSTSPR | | TSTNFSPMRP |
QQPNLQHLKS | | SPPGFPFPGP | | PNFPPQSMFG | | FPPHLPPPLL | | PPPGFGFAQN |
PMVPWPPVVH | | LPGQPQRMMG | | PLSQASRYIG | | PQNFYQVKDI | | RRPERRHSDP |
WGRQDQQQLD | | RPFNRGKGDR | | QRFYSDSHHL | | KRERHEKEWE | | QESERHRRRD |
RSQDKDRDRK | | SREEGHKDKE | | RARLSHGDRG | | TDGKASRDSR | | NVDKKPDKPK |
SEDYEKDKER | | EKSKHREGEK | | DRDRYHKDRD | | HTDRTKSKR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|