Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NKX3-1
|
---|
|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NKX3-1, BAPX2, NKX3, NKX3.1, NKX3A, NK3 homeobox 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602041 MGI: 97352 HomoloGene: 4494 GeneCards: NKX3-1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • histone deacetylase binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • estrogen receptor activity • protein kinase activator activity • protein self-association • MADS box domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • estrogen receptor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • site of DNA damage
|
---|
Біологічний процес |
• somitogenesis • androgen receptor signaling pathway • cellular response to steroid hormone stimulus • dorsal aorta development • positive regulation of protein phosphorylation • male gonad development • positive regulation of cell death • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein kinase B signaling • response to testosterone • epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of androgen secretion • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of apoptotic signaling pathway • prostate gland development • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • salivary gland development • heart development • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of response to DNA damage stimulus • branching involved in prostate gland morphogenesis • negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development • positive regulation of cell population proliferation • cellular response to interleukin-1 • negative regulation of epithelial cell proliferation • negative regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • urogenital system development • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • metanephros development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • branching morphogenesis of an epithelial tube • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of cell division • cellular response to hypoxia • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of mitotic cell cycle • pharyngeal system development • activation of protein kinase activity • regulation of protein localization • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • диференціація клітин
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 8: 23.68 – 23.68 Mb
| Хр. 14: 69.43 – 69.43 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
NKX3-1 (англ. NK3 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот, а молекулярна маса — 26 350[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLRVPEPRPG | | EAKAEGAAPP | | TPSKPLTSFL | | IQDILRDGAQ | | RQGGRTSSQR |
QRDPEPEPEP | | EPEGGRSRAG | | AQNDQLSTGP | | RAAPEEAETL | | AETEPERHLG |
SYLLDSENTS | | GALPRLPQTP | | KQPQKRSRAA | | FSHTQVIELE | | RKFSHQKYLS |
APERAHLAKN | | LKLTETQVKI | | WFQNRRYKTK | | RKQLSSELGD | | LEKHSSLPAL |
KEEAFSRASL | | VSVYNSYPYY | | PYLYCVGSWS | | PAFW |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|